在ASP.NET应用程序中，可以选择是否继续使用APP_CODE目录来存放代码文件。APP_CODE目录是一个特殊目录，用于存放应用程序的源代码文件。

如果您想继续使用APP_CODE目录，可以按照以下步骤进行设置：

1. 在应用程序的根目录下创建一个名为"App_Code"的文件夹。

2. 将您的代码文件（.cs或.vb文件）放入"App_Code"文件夹中。

3. 在Web应用程序中，您可以直接使用"App_Code"文件夹中的代码文件，而无需进行额外的配置。

以下是一个示例代码，演示了如何在ASP.NET应用程序中使用APP_CODE目录：

// 在App_Code目录下创建一个名为"HelloWorld.cs"的文件

using System;

namespace MyApp
{
    public class HelloWorld
    {
        public static void SayHello()
        {
            Console.WriteLine("Hello, World!");
        }
    }
}

// 在Web应用程序中的某个页面或代码文件中调用App_Code中的代码

using MyApp;

protected void Page_Load(object sender, EventArgs e)
{
    HelloWorld.SayHello();
}

注意：使用APP_CODE目录存放代码文件的一个限制是，这些代码文件将会在运行时自动编译，并且不能包含任何命名空间。所以，您必须确保在App_Code文件夹中的代码文件中没有命名空间声明。