在使用ASP.NET的Web应用程序中，如果尝试调用API Controller时出现未找到的错误提示，则可能是由以下问题导致的：

1. 控制器名称错误：首先需要确保在应用程序中正确命名了控制器。如果控制器的命名不正确，系统将无法找到它并抛出“未找到控制器”的异常。例如，控制器类的名称为“OrderController”，那么在使用控制器时就应该写成“api/Order”。

2. 控制器位置错误：如果控制器类的文件位置不正确，也会导致系统无法找到它。在ASP.NET中，控制器类应该放在“Controllers”文件夹下，并且应该位于命名空间“WebApplication.Controllers”中。如果控制器放错了位置或者命名空间不正确，就需要进行相应的更改。

3. 未正确设置路由：ASP.NET中的路由映射将URL映射到控制器和动作。如果路由没有正确设置，也会导致系统无法找到控制器。在确保控制器名称和位置正确的前提下，需要检查路由配置是否正确。例如，如果使用默认路由配置，则应该有以下代码：

config.MapHttpRoute(
    name: "API Default",
    routeTemplate: "api/{controller}/{id}",
    defaults: new { id = RouteParameter.Optional }
);

以上就是ASP.NET中API Controller未找到的问题及其解决方法。如果以上解决方法都不起作用，可以考虑检查应用程序中的其他配置是否正确，并尝试重新启动应用程序以使更改生效。