在Android Studio中，如果Native JNI文件找不到Java文件的路径，可以按照以下步骤解决：

1. 确保Java文件和Native JNI文件在正确的位置。

2. 在Java文件中添加native方法声明，例如：

public class NativeUtils {
    static {
        System.loadLibrary("native-lib");
    }

    public native int calculateSum(int a, int b);
}

3. 在Terminal中使用javah命令生成C/C++头文件，例如：

javah -classpath  -d  .

其中，是Java类文件的路径，是生成的头文件的输出目录，是Java类的包名，是Java类的名称。例如：

javah -classpath app/build/intermediates/classes/debug -d jni com.example.app.NativeUtils

4. 在app/build.gradle文件中添加ndk配置，例如：

android {
    // ...
    defaultConfig {
        // ...
        externalNativeBuild {
            ndkBuild {
                path 'jni/Android.mk'
            }
        }
    }

    // ...
    externalNativeBuild {
        ndkBuild {
            path 'jni/Android.mk'
        }
    }
}

5. 在jni/Android.mk文件中添加源文件依赖关系，例如：

LOCAL_PATH := $(call my-dir)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_MODULE := native-lib
LOCAL_SRC_FILES := native-lib.c
LOCAL_LDLIBS := -llog
include $(BUILD_SHARED_LIBRARY)

6. 在jni/native-lib.c文件中实现native方法，例如：

#include 
#include 

JNIEXPORT jint JNICALL
Java_com_example_app_NativeUtils_calculateSum(JNIEnv *env, jobject instance, jint a, jint b) {
    return a + b;
}

7. 点击"Sync Now"按钮以同步项目。

这样，就可以在Java代码中调用Native JNI方法了。如果仍然无法找到Java文件的路径，可以尝试重新编译项目或重启Android Studio。