如果在Android Studio中的所有XML布局都被破坏了，现在包含了Java代码，可能是由于以下原因之一：

1. XML文件的格式错误：检查XML布局文件中是否存在语法错误，例如标签没有正确关闭、属性名称拼写错误等。确保XML文件的完整性和正确性。

2. XML文件被删除或重命名：检查项目文件夹中的布局文件是否被删除或重命名。如果是这种情况，可以通过还原删除或重命名的文件，或者手动创建一个新的XML布局文件来解决问题。

3. 布局文件引用错误：检查Java代码中是否存在错误的布局文件引用。确保所有布局文件的引用都是正确的，并且与XML文件的名称相匹配。

下面是一个解决方法的示例：

1. 检查XML文件的格式是否正确并修复任何错误。

2. 确保XML布局文件存在并且命名正确。

3. 在Java代码中找到包含错误布局文件引用的位置。

4. 修复引用错误，确保它与正确的XML布局文件名称匹配。

例如，如果你的Java代码中有以下行：

setContentView(R.layout.activity_main);

确保activity_main是正确的XML布局文件的名称。

如果上述步骤都没有解决问题，可能需要进一步检查项目的其他部分，例如Gradle依赖项或其他配置文件，以确定是否存在其他问题。