如果在Athena/S3清单查询中返回了重复行，可以尝试以下解决方法：

1. 使用DISTINCT关键字：在查询中使用DISTINCT关键字可以去除重复的行。例如：

SELECT DISTINCT column1, column2, ...
FROM table_name;

2. 使用GROUP BY语句：通过使用GROUP BY语句将查询结果按照指定的列进行分组，可以去除重复的行。例如：

SELECT column1, column2, ...
FROM table_name
GROUP BY column1, column2, ...;

3. 使用ROW_NUMBER函数：使用ROW_NUMBER函数为每一行添加一个序号，然后通过筛选序号为1的行来去除重复行。例如：

WITH CTE AS (
  SELECT column1, column2, ..., ROW_NUMBER() OVER (PARTITION BY column1, column2, ... ORDER BY column1) AS row_num
  FROM table_name
)
SELECT column1, column2, ...
FROM CTE
WHERE row_num = 1;

4. 使用CTE和DISTINCT结合：结合CTE（公共表表达式）和DISTINCT关键字，可以通过CTE去除重复行，然后使用DISTINCT关键字确保查询结果中没有重复的行。例如：

WITH CTE AS (
  SELECT column1, column2, ...
  FROM table_name
)
SELECT DISTINCT column1, column2, ...
FROM CTE;

以上是一些常见的解决方法，根据具体情况选择适合的方法来处理Athena/S3清单查询返回的重复行。