AutodockGPU安装的编译问题
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安装CUDA工具包。如果您还没有安装CUDA工具包，请按照您操作系统的要求进行安装。（本文假设CUDA版本为10.0）
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构建CUDA程序时需要使用nvcc编译器。在终端窗口中输入以下命令，将nvcc路径添加到PATH环境变量中：
export PATH=/usr/local/cuda-10.0/bin${PATH:+:${PATH}}
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下载并安装MPI。 MPI (Message Passing Interface) 是一种消息传递编程模型，可用于在许多计算节点之间进行通信。可以下载OpenMPI进行安装。
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下载并安装AutodockGPU。建议从官方网站下载 AutodockGPU 的最新版本。
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在未修改 AutodockGPU 源代码的情况下，复制批处理脚本autodock_gpu_64bit.linux.csh到你的工作目录中，并运行它。此脚本将编译和链接 AutodockGPU，使用OpenMPI进行分布式计算。
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如果编译失败，可以尝试以下步骤：
a) 修复 Makefile
在AutodockGPU源代码目录下，打开Makefile文件，查找以下代码行：
CFLAGS = -g -I. -I${MPI_INCLUDE_DIR}
将其改为：
CFLAGS = -g -I. -I${MPI_INCLUDE_DIR} -DALIGN32BIT
保存并将其作为编译参数重新运行 make 命令。
b) 修复一个错误的链接器选项
在AutodockGPU源代码目录下，打开Makefile文件，找到以下代码行：
LDFLAGS = -lm -lmpi -lcudart
将其改为：
LDFLAGS = -lm -lmpi -lcudart -L/usr/local/cuda-10.0/lib64 -lcudadevrt
保存并将其作为编译