要使用AutoMapper从IConfigurationSection集合进行复杂映射，可以按照以下步骤进行操作：

1. 首先，确保已经安装了AutoMapper和Microsoft.Extensions.Configuration包。可以通过NuGet包管理器或命令行运行以下命令来安装它们：

Install-Package AutoMapper
Install-Package Microsoft.Extensions.Configuration

2. 创建一个映射配置文件，其中定义了从IConfigurationSection集合到目标类型的映射。例如，假设有一个名为AppSettings的配置节，其中包含了一些配置项，可以定义如下的映射配置文件：

using AutoMapper;
using Microsoft.Extensions.Configuration;

public class AppSettings
{
    public string ConnectionString { get; set; }
    public int MaxItems { get; set; }
}

public class AppSettingsProfile : Profile
{
    public AppSettingsProfile()
    {
        CreateMap()
            .ForMember(dest => dest.ConnectionString, opt => opt.MapFrom(src => src["ConnectionString"]))
            .ForMember(dest => dest.MaxItems, opt => opt.MapFrom(src => int.Parse(src["MaxItems"])));
    }
}

3. 在应用程序的启动代码中，配置AutoMapper并使用IConfigurationSection集合进行映射。例如，可以在Startup.cs文件的ConfigureServices方法中进行配置：

using AutoMapper;
using Microsoft.Extensions.Configuration;

public class Startup
{
    private readonly IConfiguration _configuration;

    public Startup(IConfiguration configuration)
    {
        _configuration = configuration;
    }

    public void ConfigureServices(IServiceCollection services)
    {
        // 配置AutoMapper
        services.AddAutoMapper(typeof(AppSettingsProfile));

        // 映射配置
        var appSettingsSection = _configuration.GetSection("AppSettings");
        var appSettings = Mapper.Map(appSettingsSection);

        // 将映射结果添加到DI容器中
        services.AddSingleton(appSettings);
    }
}

在上面的示例中，我们首先在ConfigureServices方法中使用services.AddAutoMapper方法配置了AutoMapper，指定了包含AppSettingsProfile的程序集。然后，我们使用_configuration.GetSection方法获取AppSettings配置节，并使用Mapper.Map方法将其映射到AppSettings类型。最后，我们将映射结果添加到DI容器中，以便在应用程序的其他地方可以方便地使用。

这样，我们就可以在应用程序的其他地方通过依赖注入来获取映射后的AppSettings对象，并使用其中的属性进行操作。