使用Automapper进行继承映射时，如果想要排除扁平化属性，可以通过自定义解析器来实现。以下是一个示例代码：

public class Parent
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
}

public class Child : Parent
{
    public string ChildProperty { get; set; }
}

public class ParentDto
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
}

public class ChildDto : ParentDto
{
    public string ChildProperty { get; set; }
}

public class CustomMappingProfile : Profile
{
    public CustomMappingProfile()
    {
        CreateMap();

        CreateMap()
            .IncludeBase()
            .ForMember(dest => dest.ChildProperty, opt => opt.Ignore());
    }
}

public class MappingService
{
    private IMapper _mapper;

    public MappingService()
    {
        var mappingConfig = new MapperConfiguration(cfg =>
        {
            cfg.AddProfile();
        });

        _mapper = mappingConfig.CreateMapper();
    }

    public ChildDto MapChildToChildDto(Child child)
    {
        return _mapper.Map(child);
    }
}

在上面的示例中，我们定义了一个父类Parent和一个继承自Parent的子类Child。我们还定义了相应的DTO类ParentDto和ChildDto。

然后，我们创建了一个自定义的CustomMappingProfile，在其中定义了映射规则。对于Child到ChildDto的映射，我们使用IncludeBase方法来包含父类的映射规则，并使用ForMember方法来排除扁平化属性ChildProperty。

最后，我们在MappingService中初始化CustomMappingProfile并使用IMapper接口进行映射操作。在MapChildToChildDto方法中，我们传入一个Child对象并使用_mapper.Map方法将其映射为ChildDto对象。

这样，当我们调用MapChildToChildDto方法时，Automapper会根据我们定义的映射规则进行映射，并排除ChildDto中的扁平化属性ChildProperty。