要从EF Core代理实体的ICollection属性中移除所有元素，可以使用以下代码示例：

// 使用AutoMapper进行映射配置
var config = new MapperConfiguration(cfg =>
{
    cfg.CreateMap();
});

var mapper = config.CreateMapper();

// 获取EF Core代理实体
var sourceEntity = dbContext.SourceEntities.FirstOrDefault();

// 使用AutoMapper将源实体映射到目标实体
var destinationEntity = mapper.Map(sourceEntity);

// 移除目标实体的ICollection属性中的所有元素
destinationEntity.CollectionProperty.Clear();

// 将修改保存回数据库
dbContext.SaveChanges();

在这个示例中，我们首先创建了一个AutoMapper的映射配置，并使用该配置创建了一个映射器。然后，我们从数据库中获取了一个EF Core代理实体，并使用映射器将其映射到目标实体。接下来，我们可以使用ICollection的Clear()方法来移除目标实体的集合属性中的所有元素。最后，我们将修改保存回数据库。请确保在保存更改之前已经初始化了数据库上下文（dbContext）。