在使用AutoMapper和.NET Core时，如果配置文件无效，可能是由于配置的问题导致的。下面是一个解决方法的示例：

1. 首先，确保已经在项目中安装了AutoMapper和AutoMapper.Extensions.Microsoft.DependencyInjection包。

2. 在Startup.cs文件中，添加以下代码来配置AutoMapper：

using AutoMapper;

public void ConfigureServices(IServiceCollection services)
{
    // 添加AutoMapper配置
    services.AddAutoMapper(typeof(Startup));
    
    // ...
}

3. 创建一个Profile类，该类继承自AutoMapper的Profile类，并在其中配置映射规则。例如，创建一个名为MappingProfile的类：

using AutoMapper;

public class MappingProfile : Profile
{
    public MappingProfile()
    {
        // 添加映射规则
        CreateMap();
    }
}

4. 在Startup.cs文件的ConfigureServices方法中，将MappingProfile类添加到AutoMapper配置中：

using AutoMapper;

public void ConfigureServices(IServiceCollection services)
{
    // 添加AutoMapper配置
    services.AddAutoMapper(typeof(Startup), typeof(MappingProfile));
    
    // ...
}

5. 在需要进行映射的地方，通过依赖注入来获取IMapper实例，并使用Map方法进行对象的映射。例如，在控制器中的一个方法中：

using AutoMapper;

public class MyController : Controller
{
    private readonly IMapper _mapper;

    public MyController(IMapper mapper)
    {
        _mapper = mapper;
    }
    
    public IActionResult MyAction()
    {
        // 创建源对象
        var source = new SourceModel { Name = "John", Age = 25 };
        
        // 映射为目标对象
        var destination = _mapper.Map(source);
        
        // ...
    }
}

通过以上步骤，可以确保AutoMapper的配置文件生效，并在需要的地方进行对象的映射。