使用Automapper库将扁平模型的列表映射到带有内部列表的复杂实体的解决方法如下：

首先，确保已安装Automapper库。可以通过NuGet包管理器或在项目文件中添加依赖项进行安装。

接下来，创建源模型和目标模型。假设我们有以下扁平模型和复杂实体：

public class SourceModel
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
    public int InnerId { get; set; }
    public string InnerName { get; set; }
}

public class DestinationModel
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
    public List InnerModels { get; set; }
}

public class InnerModel
{
    public int Id { get; set; }
    public string Name { get; set; }
}

然后，创建Automapper配置。在项目的某个地方，例如Startup.cs文件中的ConfigureServices方法中，添加以下代码：

using AutoMapper;

public void ConfigureServices(IServiceCollection services)
{
    // ...其他配置代码...

    // 添加Automapper配置
    services.AddAutoMapper(typeof(Startup));

    // ...其他配置代码...
}

public class MappingProfile : Profile
{
    public MappingProfile()
    {
        CreateMap()
            .ForMember(dest => dest.InnerModels, opt => opt.MapFrom(src => new List
            {
                new InnerModel
                {
                    Id = src.InnerId,
                    Name = src.InnerName
                }
            }));
    }
}

在上述代码中，我们创建了一个名为MappingProfile的类，继承自Automapper的Profile类。在构造函数中，使用CreateMap方法创建源模型到目标模型的映射。使用ForMember方法配置InnerModels属性的映射，通过Lambda表达式指定如何从源模型中获取内部列表的值。

最后，在需要进行映射的地方，例如控制器的Action方法中，使用Automapper的Map方法执行映射：

using AutoMapper;

public class MyController : Controller
{
    private readonly IMapper _mapper;

    public MyController(IMapper mapper)
    {
        _mapper = mapper;
    }

    public IActionResult MyAction(List sourceModels)
    {
        var destinationModels = _mapper.Map>(sourceModels);
        // 使用映射后的目标模型进行后续操作
        // ...
    }
}

在上述代码中，我们注入了IMapper接口，并在MyAction方法中使用Map方法将源模型列表映射为目标模型列表。然后，可以使用映射后的目标模型进行后续操作。

这样，我们就成功地使用Automapper将扁平模型的列表映射到带有内部列表的复杂实体。