这个问题可能是由于两个版本使用的配置文件不同导致的。可以尝试使用环境变量来控制不同的配置。以下是一个在Flask应用程序中使用环境变量的示例：

import os
from flask import Flask

app = Flask(__name__)
config_name = os.environ.get('APP_SETTINGS')

app.config.from_object(config_name)

@app.route('/')
def hello():
    return "Hello World!"

if __name__ == '__main__':
    app.run()

在上面的例子中，应用程序使用环境变量APP_SETTINGS中的配置名称来加载不同的设置。例如，您可以将环境变量设置为"config.DevelopmentConfig"以加载开发设置。在本地版本中，这个环境变量可以在一个.env文件中设置，而在EC2实例上，可以在实例启动时指定环境变量。

另一个解决方法是检查应用程序所需的所有依赖项是否在AWS EC2上正确安装。如果缺少某些依赖项，可能会导致应用程序在AWS EC2上运行时发生错误。可以使用pipenv或其他方式来安装必要的依赖项。