要在AWS Elastic Beanstalk上运行Django应用程序并迁移数据库，需按照以下步骤操作：

1. 安装aws cli并设置

pip install awscli
aws configure

2. 在Django项目的根目录中创建.ebextensions/目录，其中X.config文件名可以是任何名称。

mkdir .ebextensions
touch .ebextensions/X.config

3. 添加以下内容，使EB支持Django Migrations：

option_settings:
  aws:elasticbeanstalk:application:environment:
    DJANGO_SETTINGS_MODULE: 'myproject.settings'
  aws:elasticbeanstalk:container:python:
    WSGIPath: myproject/wsgi.py

container_commands:
  01_migrate:
    command: "/opt/python/run/venv/bin/python3 manage.py migrate --noinput"

  02_collectstatic:
    command: "/opt/python/run/venv/bin/python3 manage.py collectstatic --noinput"

4. 执行以下命令打包并上传代码到AWS Beanstalk：

git add .
git commit -m "Initial commit."
eb init -p python-3.7 my_app --region us-west-2
eb create my-env-name --single --cname my-app-name --instance_type t3.micro

5. 您将看到一些输出，应等待EB环境启动并部署项目。

这些步骤会使Django迁移正常工作，并自动迁移数据库。

注意：此处的myproject和my_env_name应更改为您特定的项目和环境名称。