要解决Android/Gradle 3.2.1中排除文件不起作用的问题，可以尝试以下方法：

1. 确保正确排除文件：在Gradle文件中，使用exclude关键字来排除文件。例如，如果要排除某个目录下的所有文件，可以使用以下代码：

android {
    // ...
    packagingOptions {
        exclude '**/your_directory/**'
    }
}

2. 清除缓存并重新构建：有时候，Gradle可能会缓存之前的构建结果，导致排除文件的更改不生效。可以尝试清除Gradle缓存并重新构建项目，以确保排除文件生效。

3. 检查依赖关系：如果排除文件的依赖关系发生变化，可能会导致排除文件不起作用。可以检查项目的依赖关系，并确保没有其他依赖引入了排除文件。

4. 检查Gradle版本：有时候，Gradle版本可能会影响排除文件的行为。可以尝试升级或降级Gradle版本，以查看是否解决了问题。

5. 检查目标文件是否正确：确保要排除的文件或目录路径是正确的，并且与Gradle文件中的路径匹配。

请注意，以上方法可能因项目的特定情况而异。如果仍然遇到问题，可以尝试在相关的开发社区或论坛上寻求帮助，以获取更详细的解决方案。