要解决Android嵌套偏好设置无法正常工作的问题，可以尝试以下方法：

1. 确保在正确的位置加载和保存偏好设置。偏好设置应该在Activity或Fragment的onCreate()方法中加载，并在onPause()或onDestroy()方法中保存。以下是一个示例：

public class MyActivity extends AppCompatActivity {

    private SharedPreferences sharedPreferences;

    @Override
    protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
        super.onCreate(savedInstanceState);
        setContentView(R.layout.activity_my);

        // 加载偏好设置
        sharedPreferences = getPreferences(Context.MODE_PRIVATE);
        // 或者使用下面的代码来加载偏好设置文件
        // sharedPreferences = getSharedPreferences("my_preferences", Context.MODE_PRIVATE);

        // 读取偏好设置值
        boolean isPreferenceEnabled = sharedPreferences.getBoolean("preference_key", false);
        
        // 设置偏好设置值
        SharedPreferences.Editor editor = sharedPreferences.edit();
        editor.putBoolean("preference_key", true);
        editor.apply();
    }

    @Override
    protected void onPause() {
        super.onPause();
        // 保存偏好设置
        SharedPreferences.Editor editor = sharedPreferences.edit();
        editor.putBoolean("preference_key", true);
        editor.apply();
    }
}

2. 确保使用正确的偏好设置键。确保在加载和保存偏好设置时使用相同的键。如果键不匹配，偏好设置将无法正常工作。

3. 检查偏好设置的默认值。如果偏好设置的默认值与您期望的不一致，可能会导致问题。确保在加载偏好设置时使用正确的默认值。

4. 重启应用程序。有时，嵌套偏好设置可能会出现问题，重启应用程序可能会解决问题。

如果上述方法都无法解决问题，您可能需要进一步调查您的代码是否存在其他可能导致偏好设置无法正常工作的问题。可能需要检查代码中的其他相关逻辑或与偏好设置相关的错误。