在Android上配对BLE设备时弹出两个对话框的问题通常是由于使用的库或API的不当引起的。为了解决这个问题，我们可以采取以下步骤：

1. 确认使用的库或API是否在Android版本中得到支持。
2. 尝试使用不同的库或API，以检查是否存在相同的问题。
3. 确认代码是否正确处理设备发出的指令，并且没有重复发出相同指令的程序。
4. 使用下面的代码片段来检查是否存在多个回调函数或接口实现等代码问题。

private final BluetoothGattCallback mGattCallback = new BluetoothGattCallback() {
    @Override
    public void onConnectionStateChange(BluetoothGatt gatt, int status, int newState) {
        super.onConnectionStateChange(gatt, status, newState);
        if (newState == BluetoothProfile.STATE_CONNECTED) {
            gatt.discoverServices();
            deviceConnected = true;
        } else if (newState == BluetoothProfile.STATE_DISCONNECTED) {
            deviceConnected = false;
            gatt.close();
        }
    }

    @Override
    public void onServicesDiscovered(BluetoothGatt gatt, int status) {
        super.onServicesDiscovered(gatt, status);
        if (status == BluetoothGatt.GATT_SUCCESS) {
            // do something
        }
    }

    @Override
    public void onCharacteristicChanged(BluetoothGatt gatt, BluetoothGattCharacteristic characteristic) {
        super.onCharacteristicChanged(gatt, characteristic);
        // do something
    }
};

在这个代码片段中，我们可以看到所有的回调函数都在同一个类中实现，可以避免重复实现回调函数的问题。此外，避免使用过时的库或API也有助于解决此问题。