问题描述：在Android应用程序的Manifest文件中，定义了两个活动（Activity），同时在app.Application文件中也定义了两个活动，导致应用程序起始时会出现两个活动。

解决方法：

1. 检查Manifest文件中的活动定义，确保只有一个活动被指定为启动活动（通过设置intent-filter和action为"android.intent.action.MAIN"和"android.intent.category.LAUNCHER"）。

示例：

2. 检查app.Application文件中的活动定义，确保只有一个活动被定义。将多余的活动定义移除或注释掉。

示例：

public class MyApplication extends Application {
    @Override
    public void onCreate() {
        super.onCreate();
        // 注释或移除多余的活动定义
        // registerActivity("Activity2");
        // registerActivity("Activity3");
    }
}

3. 清除应用程序的构建缓存并重新构建应用程序，确保修改生效。

这些步骤将确保应用程序只有一个启动活动，避免出现两个活动同时启动的问题。