要实现Android通知点击只能打开应用程序第一次生效的功能，可以通过以下方法来实现：

1. 在应用程序的启动页（例如MainActivity）中，添加一个变量来标记应用程序是否已经启动过。

public class MainActivity extends AppCompatActivity {
    private boolean isFirstLaunch = true;

    @Override
    protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
        super.onCreate(savedInstanceState);
        setContentView(R.layout.activity_main);

        // 检查是否是第一次启动应用程序
        if (isFirstLaunch) {
            // 处理第一次启动逻辑
            handleFirstLaunch();
        }

        // 其他的应用程序逻辑
        // ...
    }

    private void handleFirstLaunch() {
        // 设置已经启动过的标记为false
        isFirstLaunch = false;

        // TODO: 处理第一次启动逻辑，例如显示欢迎界面或引导用户进行操作等
    }
}

2. 在创建通知时，判断应用程序是否已经启动过，如果是第一次启动，则设置PendingIntent打开MainActivity，否则设置PendingIntent为null，即不做任何操作。

// 创建通知意图
Intent intent = new Intent(context, MainActivity.class);
PendingIntent pendingIntent;

if (isFirstLaunch) {
    // 如果是第一次启动，设置PendingIntent打开MainActivity
    pendingIntent = PendingIntent.getActivity(context, 0, intent, PendingIntent.FLAG_ONE_SHOT);

    // 处理通知点击事件
    NotificationCompat.Builder builder = new NotificationCompat.Builder(context, channelId)
            .setContentTitle("通知标题")
            .setContentText("通知内容")
            .setSmallIcon(R.drawable.ic_notification)
            .setContentIntent(pendingIntent)
            .setAutoCancel(true);

    // 发送通知
    NotificationManagerCompat notificationManager = NotificationManagerCompat.from(context);
    notificationManager.notify(notificationId, builder.build());
} else {
    // 如果不是第一次启动，设置PendingIntent为null
    pendingIntent = null;

    // 处理通知点击事件
    NotificationCompat.Builder builder = new NotificationCompat.Builder(context, channelId)
            .setContentTitle("通知标题")
            .setContentText("通知内容")
            .setSmallIcon(R.drawable.ic_notification)
            .setContentIntent(pendingIntent)
            .setAutoCancel(true);

    // 发送通知
    NotificationManagerCompat notificationManager = NotificationManagerCompat.from(context);
    notificationManager.notify(notificationId, builder.build());
}

通过以上代码示例，可以实现Android通知点击只能打开应用程序第一次生效的功能。首次点击通知时，会打开MainActivity并执行handleFirstLaunch()方法将isFirstLaunch标记为false，以后的通知点击将不会打开应用程序。