可以使用Anylogic Cloud API将模型和外部依赖一起打包上传至Anylogic Cloud上。在上传时，需要指定相应的读写权限，以使模型可以顺利访问并修改外部依赖。

下面是具体的代码示例，以上传包含外部依赖的模型为例：

import com.anylogic.cloud.api.*; 

// 创建ApiConnection对象 
ApiConnection connection = new ApiConnection(); 

// 连接到Anylogic Cloud 
connection.connect("<你的API密钥>"); 

// 上传模型文件和外部依赖文件 
ModelUploadInfo modelUploadInfo = connection.uploadModel("<模型文件路径>", true, null); 
ExternalFileUploadInfo externalFileUploadInfo = connection.uploadExternalFile("<外部依赖文件路径>", "<外部依赖文件名>", modelUploadInfo.id, true); 

// 设置读写权限 
AclEntry[] aclEntries = { 
     new AclEntry(AclEntryType.ROLE, "READ_ALL"), 
     new AclEntry(AclEntryType.ROLE, "WRITE_ALL") 
}; 
connection.setAclEntries(modelUploadInfo.id, aclEntries); 

// 断开连接 
connection.disconnect(); 

在上述示例中，首先通过API密钥连接到Anylogic Cloud。然后使用uploadModel方法上传模型文件，第二个参数指定是否包含外部依赖，第三个参数为null表示上传到根目录。接着使用uploadExternalFile方法上传外部依赖文件，将其和模型文件关联起来。最后使用setAclEntries方法设置访问权限，允许读写所有用户。最后断开连接。

执行以上代码后，就可以在Anylogic Cloud上运行包含外部依赖的模型，并享受公共云提供的高可用性和弹性扩展能力。