要替换Android NDK中的AAsset以使其与来自外部存储的文件一起使用以进行FFmpeg解码，可以使用标准的C库函数来代替AAsset。

下面是一个示例代码，可以从外部存储中打开一个文件并将其传递给FFmpeg进行解码：

#include 
#include 
#include 
#include 

#include 

JNIEXPORT void JNICALL
Java_com_example_ffmpegdecoder_MainActivity_decode(JNIEnv *env, jobject instance, jstring filePath) {
    const char *file_path = (*env)->GetStringUTFChars(env, filePath, 0);

    AVFormatContext *format_context = avformat_alloc_context();
    if (avformat_open_input(&format_context, file_path, NULL, NULL) != 0) {
        __android_log_print(ANDROID_LOG_ERROR, "FFmpegDecoder", "Unable to open file: %s", file_path);
        return;
    }

    if (avformat_find_stream_info(format_context, NULL) < 0) {
        __android_log_print(ANDROID_LOG_ERROR, "FFmpegDecoder", "Unable to find stream info");
        avformat_close_input(&format_context);
        return;
    }

    av_dump_format(format_context, 0, file_path, 0);

    // 接下来可以进行解码操作

    avformat_close_input(&format_context);
    (*env)->ReleaseStringUTFChars(env, filePath, file_path);
}

在上述示例代码中，Java_com_example_ffmpegdecoder_MainActivity_decode是一个JNI函数，可以从Java层调用。它接受一个文件路径作为输入参数，并使用avformat_open_input函数打开文件。

请确保在Android.mk文件中添加正确的FFmpeg库依赖项，并在应用程序的build.gradle文件中添加适当的NDK配置。

请注意，这只是一个简单的示例代码，你可能需要根据自己的项目需求进行适当的修改和错误处理。