在R语言中，anova()和Anova()函数都可以进行方差分析，但它们有一些区别。

区别1：大写的Anova()函数可以进行更多类型的方差分析，包括多元方差分析、混合模型方差分析等。

例如，如果我们想要进行多元方差分析，需要使用大写的Anova()函数。下面是一个例子：

library(car)
data(iris)
fit <- lm(cbind(Sepal.Length, Sepal.Width) ~ Species, data = iris)
Anova(fit)

区别2：小写的anova()函数在输入参数时需要将因子转换为因子型变量，而大写的Anova()函数不需要。

下面是小写的anova()函数的一个例子：

data(iris)
iris$Species <- as.factor(iris$Species)
fit <- lm(Sepal.Length ~ Species, data = iris)
anova(fit)

而使用大写的Anova()函数则可以直接输入因子变量：

library(car)
data(iris)
fit <- lm(Sepal.Length ~ Species, data = iris)
Anova(fit)

因此，在选择使用哪个函数时，需要根据分析需要和输入数据的类型和格式来进行选择。