要安全更新MySQL用户密码，可以使用以下方法：

1. 使用MySQL的内置函数来更新密码。MySQL提供了一个内置的函数PASSWORD()来加密用户密码。可以使用以下代码示例来更新密码：

UPDATE mysql.user SET authentication_string = PASSWORD('new_password') WHERE User = 'username' AND Host = 'localhost';
FLUSH PRIVILEGES;

注意替换new_password为新密码，并将username替换为要更新密码的用户名。FLUSH PRIVILEGES命令用于刷新权限。

2. 使用ALTER USER语句更新密码（MySQL 5.7及以上版本）。MySQL 5.7及以上版本提供了ALTER USER语句来更新用户密码。可以使用以下代码示例来更新密码：

ALTER USER 'username'@'localhost' IDENTIFIED BY 'new_password';

注意替换new_password为新密码，并将username替换为要更新密码的用户名。

3. 使用mysql_config_editor工具更新密码（MySQL 5.6及以上版本）。mysql_config_editor是MySQL提供的一个工具，可以帮助安全地存储和管理MySQL连接信息，包括密码。可以使用以下代码示例来更新密码：

mysql_config_editor set --login-path=local --host=localhost --user=username --password

然后，输入旧密码和新密码。这将更新存储在~/.mylogin.cnf文件中的密码。

无论使用哪种方法，都应该确保在更新密码后刷新权限，以使更改生效。

注意：在实际使用中，请根据具体情况修改代码，并确保采取适当的安全措施来保护密码的安全性。