要按索引自然排序Pandas DataFrame，可以使用sort_index()方法。下面是一个示例代码：

import pandas as pd

# 创建示例DataFrame
data = {'Name': ['Tom', 'Nick', 'John', 'Sam'],
        'Age': [20, 21, 19, 22],
        'City': ['New York', 'Paris', 'London', 'Tokyo']}
df = pd.DataFrame(data, index=['b', 'd', 'a', 'c'])

# 按索引自然排序
df_sorted = df.sort_index()

print(df_sorted)

输出结果：

  Name  Age      City
a  John   19    London
b   Tom   20  New York
c   Sam   22     Tokyo
d  Nick   21     Paris

在上述代码中，我们首先创建了一个示例DataFrame，并指定了一个自定义的索引。然后使用sort_index()方法按索引自然排序DataFrame，并将结果存储在df_sorted变量中。最后，打印出排序后的DataFrame。