要自定义ApexCharts的标记颜色，可以使用ApexCharts的options属性中的theme对象来设置颜色。下面是一个示例代码：

// 引入ApexCharts库
import ApexCharts from 'apexcharts';

// 创建一个包含标记颜色的数组
const markerColors = ['#FF0000', '#00FF00', '#0000FF'];

// 创建一个options对象，并设置theme属性
const options = {
  theme: {
    markers: {
      colors: markerColors
    }
  }
};

// 创建一个chart实例
const chart = new ApexCharts(document.querySelector("#chart"), options);

// 渲染chart
chart.render();

上面的代码中，我们首先引入了ApexCharts库，然后创建了一个包含标记颜色的数组markerColors。接下来，我们创建了一个options对象，并在其中设置了theme属性，其中markers属性用于设置标记的颜色，将markerColors数组作为值传递给colors属性。最后，我们使用options对象创建了一个chart实例，并将其渲染到具有id为"chart"的元素上。

请注意，上面的示例中使用了ES6的模块导入语法，如果你在项目中使用的是不同的模块系统或没有使用模块系统，你需要根据具体情况修改引入ApexCharts库的方式。