在Apex中使用SOQL执行upsert操作，需要按照以下步骤进行操作：

1. 首先，创建一个唯一字符串字段的目标对象。例如，假设我们要将数据插入到名为"Account"的对象中，并且有一个唯一字符串字段"ExternalId__c"。

2. 创建一个包含要upsert的记录的列表。每个记录必须包含一个唯一字符串字段的值。

List accountsToUpsert = new List();
accountsToUpsert.add(new Account(ExternalId__c = 'ABC123', Name = 'Test Account 1'));
accountsToUpsert.add(new Account(ExternalId__c = 'DEF456', Name = 'Test Account 2'));

3. 使用SOQL查询来查找已存在的记录。在查询中使用"IN"关键字，并将唯一字符串字段的值作为参数传递。

List existingAccounts = [SELECT Id, ExternalId__c FROM Account WHERE ExternalId__c IN :accountsToUpsert];

4. 创建一个Map来存储已存在记录的唯一字符串字段值和对应的记录Id。这将帮助我们在upsert操作中更新现有记录。

Map existingAccountsMap = new Map();
for (Account acc : existingAccounts) {
    existingAccountsMap.put(acc.ExternalId__c, acc.Id);
}

5. 创建一个新的列表来存储要插入和更新的记录。

List accountsToInsert = new List();
List accountsToUpdate = new List();

for (Account acc : accountsToUpsert) {
    if (existingAccountsMap.containsKey(acc.ExternalId__c)) {
        acc.Id = existingAccountsMap.get(acc.ExternalId__c);
        accountsToUpdate.add(acc);
    } else {
        accountsToInsert.add(acc);
    }
}

6. 使用upsert关键字执行upsert操作。

upsert accountsToInsert ExternalId__c;
upsert accountsToUpdate ExternalId__c;

上述代码示例演示了如何使用SOQL查询和upsert操作根据唯一字符串字段执行upsert操作。请根据自己的需求进行相应的调整。