要使用arviz.plot_ppc函数绘制后验预测均值的图形,需要首先安装和导入arviz库。然后,需要有MCMC采样的后验预测数据。
下面是一个使用PyMC3库生成MCMC采样的后验预测数据,并使用arviz.plot_ppc函数绘制后验预测均值的示例代码:
import pymc3 as pm
import arviz as az
import numpy as np
# 生成示例数据
np.random.seed(0)
x = np.random.normal(0, 1, 100)
y = np.random.normal(x, 1)
# 创建模型
with pm.Model() as model:
mu = pm.Normal('mu', mu=0, sd=1)
sigma = pm.HalfNormal('sigma', sd=1)
y_obs = pm.Normal('y_obs', mu=mu, sd=sigma, observed=y)
# 进行MCMC采样
trace = pm.sample(1000, tune=1000)
# 生成后验预测数据
ppc = pm.sample_posterior_predictive(trace, model=model)
# 绘制后验预测均值图形
az.plot_ppc(az.from_pymc3(posterior_predictive=ppc), mean=True)
这段代码首先生成了示例数据x和y。然后,创建了一个PyMC3模型,其中包含一个正态分布的先验mu和一个半正态分布的先验sigma,以及一个观测数据y_obs。接下来,使用pm.sample函数进行MCMC采样,并将采样结果存储在trace中。最后,使用pm.sample_posterior_predictive函数生成后验预测数据,并使用az.plot_ppc函数绘制后验预测均值的图形。