要更新AWS EC2托管的网站的名称服务器，你可以使用AWS SDK或AWS CLI来执行以下步骤：

1. 导入必要的AWS SDK模块或安装AWS CLI。

AWS SDK示例代码：

import boto3

client = boto3.client('route53')

def update_name_servers(zone_id, name_servers):
    response = client.change_resource_record_sets(
        HostedZoneId=zone_id,
        ChangeBatch={
            'Changes': [
                {
                    'Action': 'UPSERT',
                    'ResourceRecordSet': {
                        'Name': 'example.com',
                        'Type': 'NS',
                        'TTL': 300,
                        'ResourceRecords': [
                            {'Value': name_server} for name_server in name_servers
                        ]
                    }
                }
            ]
        }
    )
    print(response)

# 使用上面的函数更新名称服务器
update_name_servers('YOUR_HOSTED_ZONE_ID', ['ns1.example.com', 'ns2.example.com'])

AWS CLI示例代码：

aws route53 change-resource-record-sets --hosted-zone-id YOUR_HOSTED_ZONE_ID --change-batch '{
    "Changes": [
        {
            "Action": "UPSERT",
            "ResourceRecordSet": {
                "Name": "example.com",
                "Type": "NS",
                "TTL": 300,
                "ResourceRecords": [
                    {"Value": "ns1.example.com"},
                    {"Value": "ns2.example.com"}
                ]
            }
        }
    ]
}'

2. 替换YOUR_HOSTED_ZONE_ID为你的托管区域的ID。
3. 将example.com替换为你的网站的域名。
4. 将ns1.example.com和ns2.example.com替换为你的名称服务器。

这些代码将创建一个资源记录集来更新名称服务器。确保你有足够的权限来执行这些操作，并且已正确配置AWS CLI。