在AWS Glue中，可以通过在Glue爬虫的配置中设置输入文件的列顺序来解决此问题。下面是一个示例代码，演示如何在AWS Glue中设置输入文件的列顺序：

import boto3

# 创建Glue客户端
glue = boto3.client('glue')

# 设置输入文件的列顺序
response = glue.update_crawler(
    Name='YourCrawlerName',  # 替换为您的爬虫名称
    Targets={
        'S3Targets': [
            {
                'Path': 's3://your-bucket/your-folder'  # 替换为您的S3路径
            },
        ]
    },
    Configuration='{"Version":1.0,"CrawlerOutput":{"Partitions":{"AddOrUpdateBehavior":"InheritFromTable"},"Tables":{"AddOrUpdateBehavior":"MergeNewColumns"}},"Grouping":{"TableGroupingPolicy":"CombineCompatibleSchemas"},"SchemaChangePolicy":{"UpdateBehavior":"UPDATE_IN_DATABASE","DeleteBehavior":"DEPRECATE_IN_DATABASE"}}',  # 替换为您的爬虫配置
    LineageConfiguration={
        'CrawlerLineageSettings': 'ENABLE'
    }
)

print(response)

请确保将YourCrawlerName替换为您的爬虫名称，s3://your-bucket/your-folder替换为您的S3路径，并根据需要修改其他配置选项。

此代码将通过update_crawler方法更新爬虫的配置，其中Configuration参数允许您设置输入文件的列顺序。在此示例中，我们使用了一个JSON字符串来设置配置，您可以根据自己的需求进行调整。

注意：在运行此代码之前，请确保您已正确配置了AWS CLI，并使用正确的访问密钥和区域。