在 Babel 7 中，你可以使用 @babel/preset-env 插件来处理 Node.js 中的模块转译问题。首先，确保安装了 @babel/preset-env：

npm install --save-dev @babel/preset-env

然后，在 Babel 的配置文件（.babelrc 或 babel.config.js）中添加以下内容：

{
  "presets": [
    [
      "@babel/preset-env",
      {
        "targets": {
          "node": "current"
        }
      }
    ]
  ]
}

这将告诉 Babel 使用 @babel/preset-env 插件来处理转译，并将目标设置为当前的 Node.js 版本。

接下来，你需要在你的代码中使用 require 来引入模块，而不是使用 import/export。例如：

const express = require('express');

最后，确保你的代码中不包含 import/export 语句，因为 Node.js 目前还不支持这些语法。

这样，Babel 将会只对你的源代码进行转译，而不会转译 node_modules 中的依赖项。