下面是一个用Python编写的解决方法，用于比较两个大型CSV文件并从差异中生成第三个文件：

import csv

def compare_csv(file1, file2, output_file):
    # 读取第一个CSV文件
    with open(file1, 'r') as f1:
        csv_reader1 = csv.reader(f1)
        data1 = set(tuple(row) for row in csv_reader1)

    # 读取第二个CSV文件
    with open(file2, 'r') as f2:
        csv_reader2 = csv.reader(f2)
        data2 = set(tuple(row) for row in csv_reader2)

    # 计算两个CSV文件的差异
    diff_data = data1.symmetric_difference(data2)

    # 将差异写入第三个CSV文件
    with open(output_file, 'w') as f:
        csv_writer = csv.writer(f)
        csv_writer.writerows(diff_data)

# 示例用法
compare_csv('file1.csv', 'file2.csv', 'diff.csv')

以上代码首先打开两个输入文件并将它们分别读取为两个集合（其中每一行都是一个元组）。然后使用symmetric_difference方法计算两个集合的差异。最后，将差异数据写入第三个CSV文件。