解决部分运行的Javascript文件的方法可以根据具体情况来决定。以下是一些可能的解决方法：

1. 检查代码错误：首先，检查JavaScript文件中是否有语法错误或逻辑错误。可以使用开发者工具的控制台来查看错误消息并进行调试。修复这些错误可能会解决部分代码无法运行的问题。

2. 确保依赖已加载：JavaScript文件可能依赖其他文件或库。确保这些依赖项已正确加载，并按正确的顺序加载。可以使用浏览器的网络面板来检查文件是否成功加载，并查看是否有任何错误或警告。

3. 检查文件顺序：如果有多个JavaScript文件，并且它们之间存在依赖关系，则需要确保按正确的顺序加载这些文件。例如，如果一个文件依赖于另一个文件中定义的函数或变量，则需要先加载第二个文件，再加载第一个文件。

4. 确保HTML元素加载完成：如果JavaScript代码需要操作HTML元素，确保在代码执行之前这些元素已经加载完成。可以使用DOMContentLoaded事件或window.onload事件来确保代码执行时DOM已经完全加载。

5. 使用调试工具：使用开发者工具的调试工具来逐行执行代码并查看变量的值。这可以帮助找到代码中的错误或逻辑问题。

6. 使用错误处理机制：在代码中使用try-catch语句来捕获可能的异常，并在出现错误时提供错误处理逻辑。这可以避免代码崩溃，同时提供错误信息以便进行调试。

7. 分析代码逻辑：仔细分析代码逻辑，查看是否存在可能导致部分代码无法运行的条件。例如，条件分支或循环可能导致部分代码不被执行。确保代码逻辑正确并覆盖所有可能的情况。

8. 更新浏览器或库版本：有时，部分代码无法运行是由于浏览器或库版本不兼容引起的。确保使用最新版本的浏览器和库，或者查看是否存在已知的兼容性问题。

以上是一些常见的解决部分运行的JavaScript文件的方法。根据具体问题和情况，可能需要结合使用这些方法或尝试其他方法来解决问题。