要停止在Docker容器内运行的服务，而不停止整个容器，可以使用以下方法：

1. 使用容器的进程管理工具（如supervisor）来管理服务进程。在Dockerfile中将supervisor安装到容器内，并配置它来启动和管理服务进程。然后，通过在容器内运行supervisord命令来启动supervisor。接下来，要停止服务，可以运行supervisorctl stop 命令来停止指定的服务进程。

Dockerfile示例：

FROM ubuntu:latest

# 安装supervisor
RUN apt-get update && apt-get install -y supervisor

# 复制supervisor配置文件
COPY supervisord.conf /etc/supervisor/conf.d/supervisord.conf

# 添加其他所需的安装和配置步骤

# 启动supervisor
CMD ["supervisord", "-n"]

supervisord.conf示例：

[supervisord]
nodaemon=true

[program:my_service]
command=/path/to/my_service

2. 使用init进程作为容器的主进程，并在init进程中启动和管理服务进程。要实现这个方法，你需要在容器中使用类似于/sbin/init的init进程替代默认的Docker容器启动脚本。然后，在init进程中启动和管理服务进程，并在需要停止服务时发送信号给服务进程来停止它。

Dockerfile示例：

FROM ubuntu:latest

# 复制替代的init进程
COPY my_init /sbin/init

# 添加其他所需的安装和配置步骤

# 启动init进程
CMD ["/sbin/init"]

3. 在容器内运行一个简单的守护进程，监听一个特定的端口或文件，并根据收到的指令来启动和停止服务进程。你可以编写一个简单的守护进程脚本，使用netcat或类似的工具来监听一个端口或文件，然后解析收到的指令来启动和停止服务进程。

守护进程示例：

#!/bin/bash

# 监听端口或文件
while true; do
  # 读取收到的指令
  command=$(nc -l -p 12345)

  # 根据指令启动或停止服务进程
  if [ "$command" = "start" ]; then
    /path/to/my_service &
  elif [ "$command" = "stop" ]; then
    pkill my_service
  fi
done

在容器内运行守护进程的命令：

/path/to/my_daemon.sh &

请注意，这些方法只是一些示例，并且可能需要根据你的具体需求进行修改和定制。