以下是一个示例的解决方法，使用Python编写：

# 定义一个函数，用于计算不同列中的值的计数器
def count_values_in_columns(data):
    # 创建一个空字典，用于存储每列中的值的计数器
    counter = {}
    
    # 遍历数据的每一行
    for row in data:
        # 遍历每一列的索引和值
        for idx, val in enumerate(row):
            # 如果当前列的索引不在计数器中，则将其添加到计数器中
            if idx not in counter:
                counter[idx] = {}
            
            # 如果当前值不在当前列的计数器中，则将其添加到计数器中，并将计数器初始化为1
            if val not in counter[idx]:
                counter[idx][val] = 1
            # 否则，将当前值的计数器加1
            else:
                counter[idx][val] += 1
    
    # 返回计数器
    return counter

# 示例数据
data = [
    [1, 2, 3],
    [1, 2, 3],
    [4, 5, 6],
    [4, 5, 6],
    [7, 8, 9],
    [7, 8, 9]
]

# 调用函数计算每列中的值的计数器
counter = count_values_in_columns(data)

# 打印计数器
for col, val_counter in counter.items():
    print(f"列 {col} 中的值计数器：{val_counter}")

输出结果为：

列 0 中的值计数器：{1: 2, 4: 2, 7: 2}
列 1 中的值计数器：{2: 2, 5: 2, 8: 2}
列 2 中的值计数器：{3: 2, 6: 2, 9: 2}

该示例中，函数count_values_in_columns接受一个二维列表作为输入数据，遍历每一行的每一列，使用字典counter来记录每列中各个值的计数器。最后，函数返回计数器。然后，我们可以遍历计数器，打印每列中的值的计数器。