是的，即使文件在不同的文件夹中，也应该使用相同的包声明。这是因为包声明是用来指示编译器文件所属的包的，从而能够在不同的文件中正确引用彼此。

例如，假设我们有以下两个文件：

src/com/example/MyClass.java
src/com/example/util/MyUtilClass.java

在这种情况下，应该使用相同的包声明，例如：

package com.example;

public class MyClass {
    // ...
}

package com.example.util;

public class MyUtilClass {
    // ...
}

这样，在 MyClass.java 中，可以正确引用 MyUtilClass，如：

package com.example;

import com.example.util.MyUtilClass;

public class MyClass {
    // ...

    public void doSomething() {
        MyUtilClass myUtil = new MyUtilClass();
        // ...
    }
}