BWA-MEM中某些多映射读取的MapQ为0的原因及其他多映射读取不是_程序开发

创始人

2025-01-12 19:00:40

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用samtools进行过滤，选择MapQ非0的多映射读取

具体代码示例：

samtools view -bq 1 file.bam > output.bam

其中，-b表示输出BAM格式文件，-q 1表示只选择MapQ值大于等于1的读取。

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