要在使用FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TASK和FLAG_ACTIVITY_NEW_TASK后修复返回按钮仍然可用，可以通过在启动新任务时保存任务栈的根引用，并在需要时恢复根引用来实现。

以下是一个示例代码，演示如何在启动新任务后修复返回按钮可用：

// 在Activity A 中启动新任务
Intent intent = new Intent(this, MainActivity.class);
intent.addFlags(Intent.FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TASK | Intent.FLAG_ACTIVITY_NEW_TASK);
startActivity(intent);

// 在启动新任务之前保存根引用
SharedPreferences preferences = getSharedPreferences("MyPrefs", MODE_PRIVATE);
SharedPreferences.Editor editor = preferences.edit();
editor.putString("rootActivity", getLocalClassName());
editor.apply();

接下来，在需要修复返回按钮可用的地方，可以使用以下代码获取根引用并启动它：

SharedPreferences preferences = getSharedPreferences("MyPrefs", MODE_PRIVATE);
String rootActivity = preferences.getString("rootActivity", null);

if (rootActivity != null) {
    try {
        Intent intent = new Intent(this, Class.forName(rootActivity));
        intent.addFlags(Intent.FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP);
        startActivity(intent);
    } catch (ClassNotFoundException e) {
        e.printStackTrace();
    }
}

通过这种方式，用户将能够在新任务中使用返回按钮，而不会返回到旧任务的活动中。

请注意，上述示例代码假设你已经正确设置了MainActivity作为新任务的启动活动。根据你的应用程序的具体情况，你可能需要相应地更改MainActivity为你的目标活动类。