要解决Apache POI无法打开嵌入文件的问题，可以尝试以下方法：

1. 确保嵌入文件的路径正确：首先，确保你提供给POI的嵌入文件路径是正确的。可以使用绝对路径或相对路径，确保路径指向正确的位置。

2. 使用正确的文件类型：确保你提供给POI的文件类型与实际文件类型匹配。例如，如果你嵌入的是一个Excel文件，确保你使用HSSFWorkbook或XSSFWorkbook来打开它，而不是使用HWPFDocument或XWPFDocument。

3. 使用正确的嵌入文件对象：在使用POI打开嵌入文件之前，你需要先获取到嵌入文件的对象。你可以使用getEmbeddedFiles方法来获取嵌入文件的列表，并使用getEmbeddedFileData方法来获取嵌入文件的数据。确保你使用正确的方法来获取嵌入文件对象。

下面是一个使用Apache POI打开嵌入文件的示例代码：

import org.apache.poi.hssf.usermodel.HSSFWorkbook;
import org.apache.poi.poifs.filesystem.DirectoryNode;
import org.apache.poi.poifs.filesystem.DocumentInputStream;
import org.apache.poi.poifs.filesystem.Entry;
import org.apache.poi.poifs.filesystem.POIFSFileSystem;

import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;

public class EmbeddedFileExample {

    public static void main(String[] args) {
        try {
            // 加载Excel文件
            POIFSFileSystem fs = new POIFSFileSystem(new FileInputStream("example.xls"));
            HSSFWorkbook workbook = new HSSFWorkbook(fs);

            // 获取嵌入文件的根目录
            DirectoryNode root = fs.getRoot();

            // 获取嵌入文件列表
            Entry entry = root.getEntry("MBD000644.pdf");

            // 获取嵌入文件的输入流
            DocumentInputStream inputStream = fs.createDocumentInputStream(entry);

            // 创建输出流
            FileOutputStream outputStream = new FileOutputStream("embedded.pdf");

            // 将嵌入文件内容复制到输出流
            byte[] buffer = new byte[1024];
            int length;
            while ((length = inputStream.read(buffer)) > 0) {
                outputStream.write(buffer, 0, length);
            }

            // 关闭输入流和输出流
            inputStream.close();
            outputStream.close();

            System.out.println("嵌入文件已成功提取到embedded.pdf");

        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

这是一个简单的示例，演示了如何使用Apache POI打开和提取嵌入在Excel文件中的文件。请确保你已经替换了文件路径和文件名，以及正确的嵌入文件名称。