要解决App Engine PHP中自定义域的Cron无法工作的问题，需要做以下步骤：

1. 确保你的自定义域已经正确地设置并绑定到App Engine应用程序。你可以在App Engine控制台中检查域设置。

2. 确保你的Cron服务正确地配置在你的app.yaml文件中。以下是一个示例app.yaml文件的Cron配置部分：

cron:
- description: daily summary job
  url: /tasks/daily-summary
  schedule: every 24 hours

3. 在你的PHP代码中，你需要使用 $_SERVER['HTTP_HOST'] 来获取当前请求的域名，以便在Cron任务中正确地构建URL。以下是一个示例代码：

$host = $_SERVER['HTTP_HOST'];
$url = "https://{$host}/tasks/daily-summary";
$response = file_get_contents($url);

4. 如果你的Cron任务仍然指向appspot域名而不是你的自定义域名，可能是因为你的DNS设置还没有生效。请确保你的自定义域名的DNS记录正确地指向App Engine的服务器。这可能需要一些时间来生效，所以请耐心等待。

通过执行以上步骤，你应该能够解决App Engine PHP中自定义域的Cron无法工作的问题。