在startup.cs文件中，使用AddJsonFile方法添加子文件夹下的配置文件：

IConfigurationBuilder builder = new ConfigurationBuilder()
     .SetBasePath(env.ContentRootPath)
     .AddJsonFile("appsettings.json", optional: false, reloadOnChange: true)
     .AddJsonFile($"appsettings.{env.EnvironmentName}.json", optional: true);

// 添加子文件夹下的配置文件
builder.AddJsonFile($"Configurations/myConfiguration.json", optional: false, reloadOnChange: true);

IConfiguration configuration = builder.Build();

在中间件的Invoke方法中通过IConfiguration对象获取子文件夹下的配置项：

public async Task Invoke(HttpContext context, IConfiguration config)
{
     var myConfigValue = config["myConfigKey"];
     // 执行中间件处理逻辑
     await _next(context);
}