要覆盖自定义设置，可以使用AutoMapper的ForAllMaps方法。以下是一个示例代码：

// 创建自定义映射配置
var config = new MapperConfiguration(cfg =>
{
    // 添加自定义映射规则
    cfg.CreateMap()
        .ForMember(dest => dest.SomeProperty, opt => opt.Ignore())
        .ForMember(dest => dest.AnotherProperty, opt => opt.MapFrom(src => src.OtherProperty));
});

// 创建映射器
var mapper = config.CreateMapper();

// 覆盖自定义设置
mapper.ForAllMaps((typeMap, mappingExpression) =>
{
    // 检查特定的类型映射
    if (typeMap.SourceType == typeof(Source) && typeMap.DestinationType == typeof(Destination))
    {
        // 覆盖自定义映射规则
        mappingExpression.ForMember(dest => dest.SomeProperty, opt => opt.MapFrom(src => src.SomeOtherProperty));
    }
});

在上面的示例中，我们首先创建了一个自定义的映射配置，并定义了一些自定义映射规则。然后，我们创建了一个映射器并使用ForAllMaps方法覆盖自定义设置。在ForAllMaps的回调函数中，我们可以检查特定的类型映射，并使用ForMember方法覆盖自定义映射规则。在这个例子中，我们检查了类型映射Source到Destination，并使用ForMember方法指定了一个新的映射规则。

请注意，ForAllMaps方法将覆盖全局的自定义设置，适用于所有类型映射。如果您只想覆盖特定的类型映射，请使用更具体的条件来检查类型映射。