AWS加密CLI不支持使用AWS KMS密钥进行加密操作，但AWS加密SDK提供了对KMS密钥的支持。可以使用AWS加密SDK for Java来加密数据并将其存储到S3中。以下是使用Java的AWS加密SDK进行加密操作的示例代码：

// 创建AWS KMS客户端
AWSKMS kms = AWSKMSClientBuilder.standard().build();

// 创建KMS主密钥
MasterKeyProvider keyProvider = new KmsMasterKeyProvider(kms, keyArn);

// 创建默认加密材料
EncryptionMaterials materials = new DefaultCryptoMaterialsManager().getMaterials(keyProvider);

// 创建加密上下文
Map encryptionContext = new HashMap<>();
encryptionContext.put("Purpose", "TestEncryption");

// 创建加密处理器
EncryptHandler encryptHandler = new EncryptHandler(materials, encryptionContext);

// 加密数据
ByteArrayInputStream inputStream = new ByteArrayInputStream("Hello World".getBytes());
ByteArrayOutputStream outputStream = new ByteArrayOutputStream();
encryptHandler.process(inputStream, outputStream);

// 将加密后的数据写入S3
AmazonS3 s3client = AmazonS3ClientBuilder.defaultClient();
s3client.putObject(bucketName, objectKey, new ByteArrayInputStream(outputStream.toByteArray()), null);

请注意，此示例代码需要替换keyArn，bucketName和objectKey。