要在Android 9（API 28）上的AlertDialog中使EditText自动获取焦点，可以通过以下步骤进行设置：

1. 创建一个AlertDialog.Builder对象，并将其与您的上下文关联起来。

AlertDialog.Builder builder = new AlertDialog.Builder(MainActivity.this);

2. 创建一个EditText对象，并设置其ID和布局参数。

final EditText editText = new EditText(MainActivity.this);
editText.setId(R.id.edit_text_id);
LinearLayout.LayoutParams layoutParams = new LinearLayout.LayoutParams(
        LinearLayout.LayoutParams.MATCH_PARENT,
        LinearLayout.LayoutParams.WRAP_CONTENT);
editText.setLayoutParams(layoutParams);

3. 将EditText添加到AlertDialog的布局中。

LinearLayout linearLayout = new LinearLayout(MainActivity.this);
linearLayout.addView(editText);
builder.setView(linearLayout);

4. 设置对话框的标题、消息和按钮。

builder.setTitle("标题");
builder.setMessage("消息");
builder.setPositiveButton("确定", new DialogInterface.OnClickListener() {
    @Override
    public void onClick(DialogInterface dialog, int which) {
        // 在这里处理确定按钮的点击事件
    }
});
builder.setNegativeButton("取消", new DialogInterface.OnClickListener() {
    @Override
    public void onClick(DialogInterface dialog, int which) {
        // 在这里处理取消按钮的点击事件
    }
});

5. 创建AlertDialog对象。

AlertDialog alertDialog = builder.create();

6. 在AlertDialog的onShow方法中，手动请求EditText获取焦点。

alertDialog.setOnShowListener(new DialogInterface.OnShowListener() {
    @Override
    public void onShow(DialogInterface dialog) {
        editText.requestFocus();
        InputMethodManager imm = (InputMethodManager) getSystemService(Context.INPUT_METHOD_SERVICE);
        imm.showSoftInput(editText, InputMethodManager.SHOW_IMPLICIT);
    }
});

7. 最后，显示AlertDialog。

alertDialog.show();

通过以上步骤，您应该能够在Android 9（API 28）上的AlertDialog中实现EditText自动获取焦点的功能。