要在index.html中更改编译后的JavaScript文件的路径，您可以使用Angular的内置变量来引用这些文件的路径。以下是解决方法的代码示例：

1. 首先，在Angular项目的angular.json文件中，找到"architect"下的"build"对象，并修改"outputPath"属性的值为您期望的编译输出路径。例如，将其修改为"dist/my-app"。

"architect": {
  "build": {
    "options": {
      "outputPath": "dist/my-app"
      ...
    }
    ...
  }
  ...
}

2. 接下来，在index.html中，使用Angular的内置变量{{baseUrl}}来引用编译后的JavaScript文件的路径。将script标签放在body结尾处，并在其src属性中使用{{baseUrl}}。

3. 这样，编译后的JavaScript文件将会被引用到{{baseUrl}}所指定的路径下，而{{baseUrl}}将会被替换为您在angular.json中指定的编译输出路径。

请确保在使用{{baseUrl}}之前，Angular应用已经编译过，并且生成了相应的JavaScript文件。

希望这可以帮助到您！