过去二十几年,自然科学最大的特点不是"发现新东西",而是把旧常识一个个推翻了。比如:基因不只来自父母,还会被环境改写;细菌不是低等生物,它有自己的免疫系统;而表观遗传,也可能是后天遗传,今天来聊聊这事。
如果你经常关注生物科学的话,那么表观遗传、甲基化等词一定如雷贯耳,这些内容真的是经常见诸于各种研究报道。这个内容事实上是非常颠覆性的一个研究。
我们都知道人类遗传是来自于父本和母本的DNA,这是遗传物质,属于先天的。而不用担心你的行为遗传。但是科学家的研究却告诉你,不一定哦!后天的内容也可以遗传!表观遗传就是发现了这个问题,比如,肥胖这种后天的行为,一样可以遗传。
我们知道人类的遗传是DNA的遗传,DNA的组成部分ATGC构成了基因本身代代传承。由于DNA双螺旋的稳定性和碱基互补,所以每一代DNA基本上保持一致,否则就不会是龙生龙凤生凤了。
然而科学家发现了一种新的遗传,那就是,哪怕DNA的序列不变,依然可以发生新的遗传。换句话说,我们看到的ATGC没有变化,然而事实上已经变了,这就是表观修饰。
给大家直观的看一个表观遗传的范例——甲基化:
如图,这是一个甲基化过程,如果简单的测序,我们会发现,这个碱基其实没发生改变,然而,右上角的CH3已经暴露了,事实上,这个碱基已经改变了。
通俗点讲,假如DNA是一个人的固定特征之一,就像我们的身份证,然而,事实上,随着岁月发展,我们变化了很多,虽然人还是那个人,但是已经面目全非了。
而这种面目全非,是后天行为可以写上去的,就像亚洲三大神器韩国的整形、日本的化妆和中国的美颜软件一样。
表观遗传(epigenetics)是指DNA序列不发生变化,但基因表达却发生了可遗传的改变。这句话通常被一些人歪曲解读,有些人直接说,表观遗传是DNA没发生改变,而发生了遗传。
扯犊子,没改变咋遗传?隔壁老王啊。他们忽略了最关键的两个字:序列
因为这是一个历史性的概念,大概在上世纪70年代,人类终于发明了DNA测序的办法,于是大家知道我们的基因是ATGC之类的,但是这种测序方法事实上有个关键的问题,就是只看内不看外。
比如A=T,G=C,然而,这种测序其实是非常僵化的(虽然直到现在我们还在用。)假如你把C变得面目全非,只要保留配对的部位即可,事实上,依然可以测出来是C。
这个时候问题就来了,事实上,它已经不是标准的C了。
所以,对于表观遗传的内容,其实认识一直比较肤浅。然而,表观遗传事实上是非常强大的。
我给大家举个简单的例子。吸烟可以遗传,无论是父亲还是母亲,长期吸烟均可以遗传到后代身上;还有肥胖也是可以遗传的。这不是那种天生胖,而是来自于后天吃胖的人发现的,比如那些早期移民他们本身比较瘦弱,然而获得大量营养物质后,迅速变得肥胖,而这种肥胖得到遗传,直接传承到下一代,导致下一代成了天生胖,其原因就是通过了表观遗传实现的。
再来个例子。1944年至1945年的冬季,荷兰(不是河南,虽然河南有个1942)。被称为“饥饿的冬天”。当时荷兰流亡政府估计纳粹德国行将崩溃,于是发动了铁路工人大罢工。纳粹德国因此切断了食物和燃料供应,引发饥荒。1945年初饥荒结束。这个对荷兰人来说是无比苦难的一个冬天,导致了大量的死亡,据称,就鹿特丹,一天就有超过400人饿死。
Hongerwinter Dutch famine of 1944–45
对于这些经历,大部分人已经离去,但是,基因却忠实的记录了这些内容。 在本文中,作者选择了一个核心的基因胰岛素样生长因子 II (IGF2). IGF2 是一个发育关键的因子,对于母体印迹非常关键。 这里的研究对象是大饥荒时期怀孕的人的后代,对照是非饥荒时期出生的兄妹。因为这样可以最大限度地排除了出生后的影响以及遗传背景不一致的问题。
怀孕期间,胎儿的营养供给都是来自母体,所以,可以直接的反应母体受到的影响,就像本文的饥荒。 首先介绍下时间,荷兰大饥荒的时间是1944年11月左右,持续到1945年5月盟军解放荷兰,说一个重要的界限是1945年6月,这在基因上完全体现出来。 一定要记住,这是2008年,也就是饥荒发生了60年后的实验。 这个研究是依据女性怀孕前最后一次月经来计算的,因为,在最后一次月经前,他们尚未意识饥饿即将发生。所以这份记录可以反映早期饥饿带来的影响。
我们可以清楚地看到,在12月到5月之间,食物供给绿色部分明显低于6月。而对应的甲基化水平比例(饥饿vs非饥饿)一直位于0以下。 这是数据
同时,饥饿直接对胎儿的身体指标产生了影响,包括体重,年龄,当然,也包括出生率。 好了,这篇文章讲完了。 总结一下:饥荒年间出生的成年人携带有独特的表观遗传学标志,这种表观遗传学改变减少了胰岛素样生长因子 IGF2 的合成,它在人体中保持了六十年。
表观遗传有三个层面,目前研究最多的是第一个
第一:表观遗传调控
研究最多的是DNA甲基化,当然也有做乙酰化的,比如sirt等。比如做DNA 甲基化酶家族,他们的异常会导致基因发生改变。
第二:代谢网络调控
甲基化一般关注不同区域甲基化差异,比如癌症和正常人基因某个区域甲基化的改变等。
第三:后天遗传
主要是环境因素和习惯因素。比如抽烟饮酒之类的或者肥胖之类的,近视也有人在做。
附上部分文献
1,一篇综述,玩表观的必备,5000多次引用:Bird A. DNA methylation patterns and epigenetic memory[J]. Genes & development, 2002, 16(1): 6-21.
2,荷兰那嘎子 Heijmans B T, Tobi E W, Stein A D, et al. Persistent epigenetic differences associated with prenatal exposure to famine in humans[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2008, 105(44): 17046-17049.