如果AWS ECS Fargate无法从EC2连接到MongoDB，可能是由于以下原因导致的：

1. 安全组配置：确保MongoDB实例的安全组允许来自ECS Fargate实例的入站连接。你可以通过以下代码示例来更新安全组配置：

import boto3

# 创建EC2和MongoDB的安全组对象
ec2_client = boto3.client('ec2')
mongo_security_group_id = 'your-mongo-security-group-id'

# 添加入站规则，允许来自ECS Fargate实例的连接
response = ec2_client.authorize_security_group_ingress(
    GroupId=mongo_security_group_id,
    IpPermissions=[
        {
            'FromPort': 27017,
            'ToPort': 27017,
            'IpProtocol': 'tcp',
            'IpRanges': [
                {
                    'CidrIp': 'your-ecs-fargate-cidr-ip',
                    'Description': 'Allow ECS Fargate to connect to MongoDB'
                },
            ],
        },
    ],
)

2. VPC路由表配置：确保ECS Fargate实例所在的VPC路由表允许流量从ECS Fargate子网流向MongoDB所在的VPC。你可以通过以下代码示例来更新路由表配置：

import boto3

# 创建EC2和VPC的客户端对象
ec2_client = boto3.client('ec2')
vpc_client = boto3.client('ec2', region_name='your-vpc-region')

# 获取ECS Fargate子网的路由表ID
ecs_fargate_subnet_id = 'your-ecs-fargate-subnet-id'
response = ec2_client.describe_route_tables(
    Filters=[
        {
            'Name': 'association.subnet-id',
            'Values': [ecs_fargate_subnet_id],
        },
    ],
)
route_table_id = response['RouteTables'][0]['RouteTableId']

# 添加流向MongoDB的路由
response = vpc_client.create_route(
    DestinationCidrBlock='your-mongo-vpc-cidr-block',
    RouteTableId=route_table_id,
    VpcPeeringConnectionId='your-vpc-peering-connection-id',
)

以上示例中的your-mongo-security-group-id需要替换为你的MongoDB实例的安全组ID，your-ecs-fargate-cidr-ip需要替换为ECS Fargate实例的CIDR IP地址，your-vpc-region需要替换为VPC所在的AWS区域，your-ecs-fargate-subnet-id需要替换为ECS Fargate实例所在的子网ID，your-mongo-vpc-cidr-block需要替换为MongoDB所在VPC的CIDR Block，your-vpc-peering-connection-id需要替换为VPC Peering连接的ID。

通过以上方法，你应该能够解决AWS ECS Fargate无法从EC2连接到MongoDB的问题。