ASP.Net Core应用程序在控制台窗口中输出可以通过使用Console.WriteLine()方法来实现。下面是一个示例代码：

using Microsoft.AspNetCore.Hosting;
using Microsoft.Extensions.Hosting;
using System;

namespace ConsoleApp
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            CreateHostBuilder(args).Build().Run();
        }

        public static IHostBuilder CreateHostBuilder(string[] args) =>
            Host.CreateDefaultBuilder(args)
                .ConfigureWebHostDefaults(webBuilder =>
                {
                    webBuilder.UseStartup();
                })
                .ConfigureLogging(logging =>
                {
                    logging.ClearProviders();
                    logging.AddConsole();
                });
    }

    public class Startup
    {
        public void Configure(IApplicationBuilder app)
        {
            app.Run(context =>
            {
                Console.WriteLine("Hello, ASP.Net Core!");
                return Task.CompletedTask;
            });
        }
    }
}

在上面的示例中，Console.WriteLine()方法被用于输出一条消息到控制台窗口。这个方法被放置在Configure()方法中的app.Run()委托中，以便在应用程序处理请求时输出消息。

通过上述示例代码，当你运行ASP.Net Core应用程序时，它将在控制台窗口中输出"Hello, ASP.Net Core!"这条消息。